การดูแลฟันปลอมฐานยืดหยุ่นนั้นมีความสำคัญมากกว่าที่หลายคนคาดคิด โดยเฉพาะการทำความสะอาดก่อนเข้านอนที่จะช่วยป้องกันคราบแบคทีเรียและเชื้อราที่อาจสะสมจนก่อให้เกิดกลิ่นปากหรือปัญหาสุขภาพช่องปากอื่นๆ จากประสบการณ์ส่วนตัว การล้างฟันปลอมด้วยน้ำอุ่นและแปรงสีฟันแบบนุ่มจะช่วยขจัดเศษอาหารและคราบได้ดี แต่ต้องระวังไม่ควรใช้คลิปหรือของมีคมในการจับหรือทำความสะอาด เพราะอาจทำให้ฟันปลอมฐานยืดหยุ่นเสียหายตามที่เห็นในข้อความ "ห้ามใช้คลิป" ซึ่งชัดเจนว่าควรหลีกเลี่ยง นอกจากนี้ การแช่ฟันปลอมในน้ำยาทำความสะอาดเฉพาะจะช่วยฆ่าเชื้อและรักษาความสะอาดได้ครบถ้วน แต่ควรเลือกน้ำยาที่เหมาะกับวัสดุฐานยืดหยุ่นเพื่อไม่ให้ฟันปลอมเกิดความเสียหาย การรักษาความสะอาดฟันปลอมถอดได้นั้นไม่เพียงแต่ทำให้รู้สึกสบายในช่องปาก แต่ยังช่วยยืดอายุการใช้งานฟันปลอมและลดความเสี่ยงการเกิดปัญหาสุขภาพช่องปากอย่างรุนแรงได้อีกด้วย ใครที่ใช้ฟันปลอมแบบฐานยืดหยุ่น ควรใส่ใจขั้นตอนเหล่านี้อย่างสม่ำเสมอ