ในประสบการณ์ของผู้ที่เป็นกรดไหลย้อน การเลือกทานเห็ดต้องระมัดระวังอย่างมาก เพราะเห็ดบางชนิดอาจกระตุ้นให้อาการกรดไหลย้อนแย่ลงได้อย่างไม่น่าเชื่อ เช่น เห็ดที่มีความเผ็ดร้อนหรือเห็ดที่มีการปรุงรสจัดแสดงความเค็มจัด ซึ่งสารอาหารในเห็ดบางชนิดอาจทำให้กรดในกระเพาะเพิ่มมากขึ้น หรือกระตุ้นการระคายเคืองในหลอดอาหาร นอกจากนี้ การปรุงอาหารด้วยเห็ดควรใช้วิธีที่ไม่เพิ่มความมันหรือความเผ็ดเกินไป เช่น การต้ม นึ่ง หรือผัดด้วยน้ำมันน้อย ๆ แทนการทอดหรือผัดด้วยน้ำมันมาก ๆ เนื่องจากอาหารมันและเผ็ดจะเป็นตัวกระตุ้นสำคัญของกรดไหลย้อน ตัวอย่างเช่น เห็ดเข็มทองหรือเห็ดนางรมที่มีความนุ่มและรสชาติไม่จัดจ้าน เหมาะสำหรับคนที่มีอาการกรดไหลย้อน และยังเป็นแหล่งโปรตีนและสารอาหารที่ดี อีกทั้งควรหลีกเลี่ยงเห็ดที่ทำให้เกิดแก๊สในกระเพาะอย่างเห็ดฟางในปริมาณมาก เพราะอาจทำให้ท้องอืดและทำให้อาการกรดไหลย้อนแย่ลงได้ ส่วนตัวแล้ว การปรับเปลี่ยนพฤติกรรมการกิน เช่น เลือกทานเห็ดในมื้อเย็นที่ไม่มากเกินไป และทานอาหารช้าๆ ช่วยลดการเกิดกรดไหลย้อนและทำให้อาการบรรเทาลง ทั้งนี้การสังเกตอาการของตนเองหลังทานเห็ดแต่ละชนิดก็สำคัญมาก เพื่อค้นหาว่าเห็ดชนิดใดที่เหมาะกับตัวเองที่สุด โดยสรุปแล้ว ไม่ได้หมายความว่าเห็ดทุกชนิดเป็นอันตรายต่อผู้ที่มีกรดไหลย้อน แต่อยู่ที่ชนิดของเห็ดและวิธีการปรุง รวมทั้งปริมาณที่ทานในแต่ละมื้อ การให้ความใส่ใจและทดลองสังเกตอาการตัวเองจะช่วยป้องกันไม่ให้อาการกรดไหลย้อนกำเริบจากเห็ดได้อย่างมีประสิทธิภาพ