การอบไอน้ำเป็นขั้นตอนสำคัญอย่างมากในกระบวนการเพาะเห็ดฟาง เพราะช่วยฆ่าเชื้อโรคและสิ่งแปลกปลอมในวัสดุเพาะเห็ด ซึ่งถ้าอบไม่ดีหรือไม่สะอาดอาจทำให้เชื้อเห็ดฟางไม่เจริญเติบโต ส่งผลให้ผลผลิตลดลงหรือล้มเหลวได้ ในขั้นตอนอบไอน้ำ ผู้เพาะเห็ดต้องควบคุมอุณหภูมิและเวลาการอบให้เหมาะสม ปกติจะอบที่อุณหภูมิประมาณ 60-80 องศาเซลเซียส ใช้เวลาประมาณ 4-6 ชั่วโมง ขึ้นอยู่กับปริมาณและชนิดของวัสดุ อีกทั้งต้องระวังอย่าให้อบร้อนเกินไปจนวัสดุชื้นเกิน หรือแห้งเกินไป เพราะจะส่งผลเสียต่อการงอกของเชื้อเห็ด การเตรียมโรงเรือนอบไอน้ำให้สะอาดและมีระบบระบายอากาศที่ดีช่วยให้การอบเป็นไปอย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังควรตรวจสอบความชื้นและตรวจดูว่าอุปกรณ์อบอยู่ในสภาพดี ไม่มีการรั่วไหลของไอน้ำ เพื่อความสม่ำเสมอของความร้อน สำหรับมือใหม่ที่เพิ่งเริ่มทำเห็ดฟาง ควรทำการทดลองอบในปริมาณเล็กน้อยก่อน เพื่อเรียนรู้และปรับปรุงเทคนิคต่างๆ และสังเกตผลลัพธ์ก่อนขยายการเพาะในปริมาณมาก การอบไอน้ำที่ดีจะช่วยเพิ่มโอกาสให้ "ตกไม่ตกวันนี้ ต้องอบให้ได้" เหมือนคำกล่าวจากชาวเพาะเห็ด โดยกระบวนการอบนี้ถือเป็นหัวใจสำคัญในการผลิตเห็ดฟางคุณภาพ และยังเป็นฐานรากของวิถีคนทำเห็ดมืออาชีพที่ยั่งยืน